1.訓練干預方法
雖然目前孤獨症的干預方法很多，但是大多缺乏循證醫學的證據。尚無最優治療方案，最佳的治療方法應該是個體化的治療。其中，教育和訓練是最有效、最主要的治療方法。目標是促進患者語言發育，提高社會交往能力，掌握基本生活技能和學習技能。孤獨症患者在學齡前一般因不能適應普通幼兒園生活，而在家庭、特殊教育學校、醫療機構中接受教育和訓練。學齡期以後患者的語言能力和社交能力會有所提高，部分患者可以到普通小學與同齡兒童一起接受教育，還有部分患者可能仍然留在特殊教育學校。
目前國際上受主流醫學推薦和使用的訓練干預方法，爲孤獨症的規範化治療提供了方向，這些主流方法主要有
(1)應用行爲分析療法(ABA)主張以行爲主義原理和運用行爲塑造原理，以正性強化爲主促進孤獨症兒童各項能力發展。訓練強調高強度、個體化、系統化。
(2)孤獨症以及相關障礙兒童治療教育課程(TEACCH)訓練該課程根據孤獨症兒童能力和行爲的特點設計個體化的訓練內容，對患兒語言、交流以及感知覺運動等各方面所存在的缺陷有針對性地進行教育，核心是增進孤獨症兒童對環境、教育和訓練內容的理解和服從。
(3)人際關係訓練法包括Greenspan建立的地板時光療法和Gutstein建立的人際關係發展干預(RDI)療法。
上述治療方法在國內一些孤獨症康復機構已開展，獲取了較好的治療效果，但還需要進一步研究論證。
2.藥物治療
目前藥物治療尚無法改變孤獨症的病程，也缺乏治療核心症狀的特異性藥物，但藥物可以改善患者的一些情緒和行爲症狀，如情緒不穩、注意缺陷和多動、衝動行爲、攻擊行爲、自傷和自殺行爲、抽動和強迫症狀以及精神病性症狀等，有利於維護患者自身或他人安全、順利實施教育訓練及心理治療。常用藥物如下：
(1)中樞興奮藥物適用於合併注意缺陷和多動症狀者。常用藥物是哌醋甲酯。
(2)抗精神病藥物應小劑量、短期使用，在使用過程中要注意藥物副作用，特別是錐體外系副作用
①利培酮對孤獨症伴發的衝動、攻擊、激越、情緒不穩、易激惹等情感症狀以及精神病性症狀有效。②氟哌啶醇對衝動、多動、刻板等行爲症狀和情緒不穩、易激惹等情感症狀以及精神病性症狀有效，據報道還可改善社會交往和語言發育障礙。③阿立哌唑、奎硫平、奧氮平等非典型抗精神病藥物在控制患者的衝動、攻擊和精神病性症狀也有效。
(3)抗抑鬱藥物能減輕重複刻板行爲、強迫症狀，改善情緒問題，提高社會交往技能，對於使用多巴胺受體阻滯劑後出現的運動障礙如退縮、遲發性運動障礙、抽動等也有一定效果。
選擇性5-HT再攝取抑制劑(SSRIs)對孤獨症患者的行爲和情緒問題有效。如舍曲林可試用於6歲以上患者。
