驗孕筆失效可以兩種型態表示：
1、已懷孕，但驗出來顯示沒有懷孕，即驗孕筆不夠敏感：可能的原因包括驗孕筆過期、藥劑已失效；另一種原因是廠商使用的藥劑有問題。
2、未懷孕，但驗出來顯示有懷孕，即驗孕筆試劑太靈敏：女性懷孕時體內的絨毛腺性激素會升高，可經由尿液驗出，驗孕筆就是在測試體內的絨毛腺性激素。但絨毛腺性激素存在於每一個人體內（包括男性），只是量較少。有些試劑因為太敏感，即使量少也可能呈陽性反應，而讓使用者誤以為懷孕了。
驗孕棒的最佳使用時間是什麼時候？太早驗與太晚驗，都可能使檢驗結果不正確。有些人在行房後2～3天就檢驗，往往驗不出正確的結果。有些人則在懷孕一段時間後才驗，然而因為絨毛腺性激素值會隨著懷孕週數增加而增加，例如10周後，數值即可能達到10萬以上，而一般的驗孕筆在超過一定的數值後即驗不出來。
如何正確驗孕？
如果對於驗孕筆標示的結果有懷疑，最好使用兩個廠牌的驗孕筆。另外更可以到婦產科檢查，婦產科醫師覺得有懷疑時，會使用不同的試劑或是將尿液稀釋來檢驗，必要時還可以抽血檢查。另外，懷孕大約到6周（從上次月經來時第一天算起）以後，可以用超聲波看看胚胎是否位於子宮內。雖然驗孕筆的準確度極高，但並非百分之百，需要仔細地確認，以免有使用驗孕筆呈陰性卻已懷孕，在誤判的情況下而服用藥物、做放射性檢查，而後來知道懷孕之後，造成終日惶惶不安的遺憾。
